A MÖJE tudományos tevékenységének szervezését, annak irányai meghatározását Tudományos Tanácsadó Testülete segíti, amelynek tagjait az egyesületi Elnökség döntése alapján az Egyesület elnöke a jogösszehasonlító jogban jártas elméleti szakemberek, illetve jogösszehasonlító módszert munkájuk során magas szinten alkalmazó gyakorlati szakértők, valamint az ilyen elméleti illetve gyakorlati szakértőket alkalmazó, vagy képviselő szervezetek köréből kéri fel.